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更新時(shí)間:2026-06-09
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懸浮細(xì)胞因其在培養(yǎng)液中均勻分布、無(wú)需消化即可直接收集的特點(diǎn),在多種下游實(shí)驗(yàn)中具有先天優(yōu)勢(shì)。本章節(jié)將聚焦懸浮細(xì)胞常用的兩大下游實(shí)驗(yàn)——流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)與RNA提取,系統(tǒng)梳理從樣品制備到實(shí)驗(yàn)完成的核心步驟與關(guān)鍵注意事項(xiàng)。
流式細(xì)胞術(shù)是分析懸浮細(xì)胞表面標(biāo)志物、細(xì)胞周期、凋亡狀態(tài)等特性的重要工具。懸浮細(xì)胞因無(wú)需消化,樣品制備更為簡(jiǎn)便快捷。
首先收獲細(xì)胞,制備單細(xì)胞懸浮液。根據(jù)細(xì)胞數(shù)量和體積,將懸液轉(zhuǎn)移到96孔板、試管或Falcon流式管中。需注意的是,如果細(xì)胞未經(jīng)任何處理直接上機(jī)檢測(cè),所有步驟應(yīng)在冰上操作,并使用4℃預(yù)冷的試劑,以防止細(xì)胞表面蛋白的內(nèi)化。
確定細(xì)胞總數(shù)并檢查細(xì)胞活力。一般來(lái)說(shuō),細(xì)胞存活率應(yīng)達(dá)到90%~95%方可進(jìn)行流式分析。如果用于凋亡檢測(cè),則需在染色后盡快完成檢測(cè),通常宜在1小時(shí)內(nèi)完成。
在4℃下以約200g離心5分鐘,棄上清后,在冰冷的懸浮緩沖液中重懸細(xì)胞沉淀。推薦的懸浮細(xì)胞濃度為0.5-1×10?個(gè)/mL。離心力和時(shí)間可能需要根據(jù)細(xì)胞類(lèi)型進(jìn)行優(yōu)化——應(yīng)充分離心以便去除上清液,但離心力不宜過(guò)大,以免細(xì)胞難以重懸。
注意:較高細(xì)胞濃度可能會(huì)堵塞流式細(xì)胞儀系統(tǒng)并影響分辨率。
死細(xì)胞容易與抗體發(fā)生非特異性結(jié)合,必須在分析時(shí)排除?;盍θ玖希ㄈ?/span>7-AAD、DAPI等)無(wú)法穿透活細(xì)胞的完整細(xì)胞膜,只能對(duì)死細(xì)胞進(jìn)行染色。
染色步驟:根據(jù)制造商說(shuō)明,在4℃避光條件下用活力染料孵育細(xì)胞。選擇發(fā)射光譜不與免疫染色所用熒光團(tuán)重疊的染料。染色后,用洗滌緩沖液洗滌細(xì)胞兩次(200g離心5分鐘,4℃),每次洗滌后重新懸浮沉淀。
注意:DAPI等活力染料不能用于固定細(xì)胞后的活/死染色,因?yàn)楣潭ㄟ^(guò)程會(huì)損害所有細(xì)胞的細(xì)胞膜,導(dǎo)致假陽(yáng)性。此時(shí)應(yīng)使用胺反應(yīng)性可固定細(xì)胞活力染料
將細(xì)胞重懸后,加入相應(yīng)的熒光素偶聯(lián)抗體,孵育后洗去未結(jié)合的抗體,用流式PBS重懸細(xì)胞于流式管中,即可上樣分析。
防止細(xì)胞損傷:避免出現(xiàn)氣泡、劇烈渦旋、更換緩沖液時(shí)吸出全部溶液以及過(guò)度離心
細(xì)胞染色后須盡快完成檢測(cè),通常宜在1小時(shí)內(nèi)完成-
將熒光團(tuán)保存在黑暗中以避免光漂白
懸浮細(xì)胞在RNA提取中具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)——無(wú)需胰酶消化,可直接離心收集,避免了消化過(guò)程對(duì)細(xì)胞狀態(tài)的影響。
將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至離心管中,室溫下以1000 rpm離心6分鐘,棄去上清。參考不同來(lái)源方法,也可采用12000 rpm 4℃離心2分鐘收集細(xì)胞,之后用預(yù)冷的1×PBS清洗兩次-。
對(duì)于懸浮細(xì)胞,可直接用吸管或移液槍吹打培養(yǎng)瓶壁,使細(xì)胞充分懸起,然后離心去上清,不需要用PBS提前洗滌-。隨后加入Trizol裂解液,每5-10×10?個(gè)細(xì)胞加入1ml Trizol,反復(fù)用移液槍吹打或劇烈震蕩以裂解細(xì)胞。
將混合好的樣品全部移至1.5ml EP管中,室溫靜置5分鐘。加入0.2ml氯仿(每1ml Trizol),蓋好管蓋,劇烈振蕩(上下顛倒)15秒,室溫靜置2-3分鐘。
2-8℃下以10500 rpm離心15分鐘。此時(shí)樣品分為三層:上層無(wú)色水相含RNA,中間層為蛋白質(zhì),下層有機(jī)相含DNA。小心取上層水相(約0.5-0.55ml)移至新的離心管中,注意不要觸及中間界面。
在上清中加入等量的異丙醇,顛倒混勻5次,室溫靜置10分鐘。2-8℃下以10500 rpm離心10分鐘,棄上清,可見(jiàn)RNA沉淀于管底。
加入1ml75%乙醇洗滌沉淀,輕輕彈起管底,2-8℃下以8500 rpm離心5分鐘,棄上清。
將EP管敞開(kāi)放在濾紙上,管口朝向酒精燈方向,室溫干燥(注意不要完-全干燥,否則RNA不易溶解)。用DEPC水溶解RNA(約30μl),分裝后取2μl電泳檢測(cè)完整性、2μl進(jìn)行濃度測(cè)定,其余分裝保存于-20℃備用。
l 防止RNase污染:全程戴好口罩和手套,使用無(wú)RNase的槍頭、離心管等耗材
l 試劑安全:Trizol含有酚等有害物質(zhì),注意個(gè)人防護(hù),操作應(yīng)在通風(fēng)良好的環(huán)境中進(jìn)行
l 細(xì)胞裂解充分:確保移液管反復(fù)吹打直至細(xì)胞完-全溶解
l 避免DNA污染:相分離時(shí)切勿吸取中間蛋白層和有機(jī)相
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